ZEN>Переключение между окнами отнимает время — без разницы как они организованы: блокнотные вкладки или же просто перекрывающиеся окна. Будет лучше, если бы нужные окна всегда бы были открыты и не перекрывались друг другом, тогда для перевода фокуса ввода между полями двух окон, например, достаточно было бы одного щелчка мышью вместо двух (активация нужного окна, перевод фокуса в нужное поле).

Убираем один щелчок, но снижаем размер полезной площади каждого окна за счет неперекрывающихся окон. Во многих случаях потеря немного больше, чем приобретение. Часто ли мы переключаемся между окнами? А часто ли нам не хватает площади окна для вывода информации? Только ответив на эти вопросы можно сделать выбор между двумя подходам.
IMHO, в учетных системах часто встречается табличный просмотр, где бОльшая площадь позволяет более комфортно ориентироваться среди десятков документов и быстрее увидеть нужный. Да и при просмотре реквизитов документа может оказаться, что оставшейся площади окна недостаточно...

Кстати, заставлять пользователя слишком часто переключаться между окнами — уже признак плохого проектирования интерфейса.