Здравствуйте, Dmi3S, Вы писали:

ЯС>> существующий код можно посмотреть в tar.gz.
DS>/home/dmi3s/work/spades-2.1.0/src/debruijn/standard.hpp:17:17: fatal error: k.hpp: No such file or directory
DS>compilation terminated.
DS>make[2]: *** [debruijn/CMakeFiles/spades.dir/main.cpp.o] Error 1
DS>make[1]: *** [debruijn/CMakeFiles/spades.dir/all] Error 2
DS>make: *** [all] Error 2
DS>[2] dmi3s@asus:~/work/spades-2.1.0/src$ find . -iname k.hpp

DS>Т.е. неплохо бы поправить CMakeLists.txt на предмет проверки зависимости. ИМХО, конечно же.

Дмитрий, у нас действительно есть проблемы с компиляцией, но, честно говоря, не прочитав manual.html шансы запустить SPAdes практически равны нулю.