M>Для фриланса теоретически, как я понимаю, это возможно, потому что согласно ГК программы приравниваются к литературным произведениям, таким образом, доход за написание программы, а тем более документации, переводов документации можно считать авторским гонораром и в таком качестве и представлять их в налоговую. В конце-концов, есть же журналисты, писатели, которые периодически, в том числе и на заказ, пишут книги, статьи в самые разные издания и все это неоднократно и тп. Я не слышал, чтобы их считали предпринимателями.

Написана ерунда полная.

ГК РФ Статья 1261. Программы для ЭВМ
http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_64629/ce1359ed5b9bd99896d7a496c7887e7c223a2cbc/

Чтобы не было никакого предпринимательства, нужно заключать лицензионный договор. Он должен обладать признаками:
http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_64629/640cbca01ece35bc535ffe5e6d96b7988d2daf6b/

Если вы автор, сделали программу сами, не по заказу, не по трудовому договору, то и лицензировать возможно у вас как у частного лица, а не предпринимателя.
Чтобы была предпринимательская деятельность, надо нанимать программистов, что-то продавать или оказывать услуги.

В случае фриланса будет предпринимательская деятельность, поскольку это не лицензирование, а услуги. Вот из-за этого:
http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_64629/e1a2a66199f94c314b8613a44d2abbad7203f7ee/

M>Но я понимаю, что теория и практика вещи разные, поэтому интересует в первую очередь, как у нас с этим практически.

Для начала надо законы почитать, а не придумывать небылицы.

PS. Почему не предпринимательская деятельность, потому что это другая деятельность. Она назыается «Распоряжение исключительным правом».
Не услуга, не продажа, а распоряжение. Здесь нет никакого риска, потому что право распоряжаться возникает автоматически у автора в момент создания произведения и не требует никаких рисков, вложений, продаж и т.п.
http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_64629/2ef636aadd9bee02a47d69d5393d32dbd576797d/

deleted