T>Можно взять еще какую-нибудь open-source реализацию MQ и выкинуть WebShpere окончательно

Дык, я не против, но WebSphere MQ, вроде как крутой зрелый продукт для JMS.
А вообще, у нас IBM технологии лишь для того, чтобы проект дороже продать.