Здравствуйте, lapkos, Вы писали:

L>Я слышал что при взаимодействии NET приложения и 32-х разрядного неуправляемого приложения
L>через интероп на 64 битной ОС возникуют большие проблемы.

L>Может кто сталкивался или знает где эта проблема обсуждается — буду рад получить любую информацию.

Обзор проблем совместимости для 32-разрядных программ в 64-разрядных версиях Windows

В дополнение можно отметить что указатели в х64 стали 8 байт вместо 4.
Соответственно если при объявлении структур или сигнатур методов Interop, подразумевающих в качестве полей или параметров указатели, используется int (Int32) вместо IntPtr, проблем не миновать.