Вопрос снят, пусть немного коряво, но работает!

string str = string.Format("<script language= \'javascript\'>  window.open(\'blablabla.aspx?id={0}'," +
                    "\'{1}\', \'width=30,height=40,toolbar=0\'); document.forms[0].submit(); </script>", lNumber, lScriptName);

плюс сбрасываем выделение в гриде

        BasicView.SelectedIndex = -1;

Смысл прост. Делаем принудительный сабмит. Который сбрасывает код скрипта.