Здравствуйте japhar, Вы писали:

J>Естественно, в редакторе должны быть средства для обзора тел, удаления невидимых линий.

Это тебе книжки почитать надо. Для разных случаев используются разные форматы, часто перед определенными действиями преобразуют из одного формата в другой или даже хранят в нескольких форматах.
Чаще всего хранят в трех списках — список вершин, список ребер, список граней.