Создаётся такое впечатление что

AppWnd:= GetForegroundWindow
id:=FindWindow('OWL_Window',Заголовок');
if (id=AppWnd)then

id

и

AppWnd

всегда неравны даже если одно приложение работает, а в этой последовательности случайно нет окон которые всегда считаются активными и находятся в фокусе???