K>>При попытке использования RegSaveKey для сохранения ключа удаленного реестра на своей машине происходит следующее:
K>> — при указании имени файла как D:\name.reg, файл сохраняется на дисек D удаленной машины, а не уменя;
AF>Не, понял как это? Диск D: замаплен на удаленную машину?
нет, вероятно речь идет об remote registry подключенном через RegConnectRegistry

K>> — при указании имени как \\Namecomp\D\name.reg (D расшарен для всех — полны доступ, NTFS — соответственно), получаю отказ в доступе (ошибка 5)
AF>используйте WNetAddConnection2 или WNetAddConnection3 перед этой операцией
Не покатит для удаленной системы. А вот NetUseAdd может помочь.

K>> Если кто-то знает как это обойти — буду оченьпризнателен за подсказку!
Попробуйте сохранять в папку windows. Она обычно автоматом расшариваться в скрытое имя ADMIN$ для админов — потом по сети оттуда и сгребайте реестр.