Здравствуйте, Tom, Вы писали:

Можно сделать так.
Находим главное окно аппликации.
Заставляем его всплыть. На сайте про это много постов.
Далее грабим. И все.

Вместо всплывания можно создать десктоп еще один и засунуть окно туда. А потом десктоп грохнуть.
В MSDN есть примерчик с десктопами.