Здравствуйте, The Minister, Вы писали:

TM>Планируется делать новый сайт с кучей JavaScript. Возникает вопрос: использовать jQuery или чистый JS?

Почему-то регулярно этот вопрос задается, даже здесь.
JQuery не нужен (все что в нем было хорошего, уже давно добавлнено в язык), чистый JS тоже (помтоу что это ужас).
Используй TS (typescript). Тем более если кода много (тогда статическая типизация просто необходима)
Современные инструменты его умеют из коробки, не сложнее чем javascirpt.