Звучит как ваша страница обрабатывает какие-то события, которые мешают генерации синтезированных (например кликов мыши) и при этом не обрабатывает тач события. Ну или комбинация этих факторов. Если отсутствует нативный скроллинг — тоже камень в эту сторону.
