В общем пока сделал мониторинг фулл-скрин через событие webkitfullscreenchange и вычисляю через window.getComputedStyle(video).position. Теоретически должно работать в плане позиционирования, но практически video перекрывает всё. Ещё и актуальный размер видео не обязательно соответствует размеру тега video.