Кто-нибудь использовал вместо обычных баз данных встроенный bolt или bbolt?
Если база будет расти скажем несколько гигабайт, как это скажется на производительности и надёжности?

Смысл решения go+bbolt в том что на боевую машину вообще ничего не нужно ставить и конфигурировать, имеем приложение само-в-себе.
Нет никаких сторонних зависимостей, ни от баз, ни от кэшей. Нужно переехать на другую машину: копируем 2 файла (само приложение и bbolt база).