Неужели никто не в курсе?

Может дело в том, что ie глюкаво обрабатывает тэг table? Сделал пример попроще, в нем нет спанов (они в принципе лишние), подсветки строк и ветки исчезают при открытии других веток. Что-то я не понял, откуда из поста выдернуть аттач, поэтому он лежит тут:
http://www.sql.ru/forum/actualfile.aspx?id=1816489