Здравствуйте, cfmm, Вы писали:
C>Есть сложная общая модель взаимодействующих каких либо объектов между которыми огромное количество различных взаимосвязей (например модель сложных инновационных процессов 
А что это за модель? Есть ли какой-нибудь конкретный пример?
C>Необходимо разработать (для начала хотя бы теоретически) или выбрать готовый "продвинутый"
визуальный интерфейс для такой системы.
В такой ситуации лучше поступить по-иному: не пытаться решить проблему сложности изобретением какого-то особенного интерфейса, а упростить модель. Например, для сложных зависимостей дать несколько "срезов".