Здравствуйте, JKC, Вы писали:

JKC>Что за флаги, где их взять и где их ставить?

Никаких особых секретных флагов или общепринятых принципов здесь нет. Флаги ставите вы, выбираете флаги опять же вы.
На ваше усморение, например:

#запускаем в режиме console-mode
./app -c 
#запускаем как daemon
./app

ставим в функции main(), при условии, что пишите на C/С++.

PS: Я хочу сказать, что вместо заменить функциональность с daemon на console, я бы выбрал добавить функциональность console, другим языком — расширил бы функционал.