Предлагаю посмотреть и обсудить Doxyrest -- мост между Doxygen и Sphinx.

Проект опубликован на GitHub под MIT-лицензией: http://github.com/vovkos/doxyrest

Статья на хабре: https://habrahabr.ru/post/318564/

Вводная документация, build-guide, а также reference по ключам командной строки и переменным, доступным из шаблонизатора: http://docs.tibbo.com/doxyrest

Пример применения: http://docs.tibbo.com/jancy/stdlib