Еще заметил, что если просто открыть проект, то закладки Design, и, соответственно, файлы *.Designer без каких либо изменений сразу же становятся "измененными" (помеченными *). Какая настройка в студии отвечает за самовольное изменение этих файлов?
На студию установлены ANTS, ReSharper.