Здравствуйте, multipasport,
Ну здесь уж раза два сказали: в чем проблема-то? Если нужен инсталлятор чтоб деплоить длл и хочется своих функций добавить — не вопрос. Возьми NSIS, это будет ГУИ инсталлятора, допиши все что тебе надо как плагин, втыкни в инсталлер — никаких зависимостей от CLR и прочего, плагины хоть на чистом С пиши.
Never underestimate those behind you...