Сорри, все форматирование съехало.
Вот как должно было быть:

Как у меня все расположено сейчас:

Projects
    Common
        *.cpp
        *.h
    MyProject1
        Specs
        Docs
        ...    
        MyProject1
            *.cpp
    MyProject2
        Specs
        Docs
        ...
        MyProject2
            *.cpp
            *.h