Здравствуйте, Andrey Gliznetsov,

в csproj в описании Item'ов нужно указать кто от кого зависит:

вместо например стандартного plain

<Compile Include="PmoEntity.cs" />
<Compile Include="PmoEntity.Access.cs"/>
<Compile Include="PmoEntity.Security.cs"/>

нуна

<Compile Include="PmoEntity.cs" />
<Compile Include="PmoEntity.Access.cs">
    <DependentUpon>PmoEntity.cs</DependentUpon>
</Compile>
<Compile Include="PmoEntity.Security.cs">
    <DependentUpon>PmoEntity.cs</DependentUpon>
</Compile>