Я не совсем понял, о каком прозрачном цвете идет речь — прозрачность в этом классе вообще не планировалась (и, соответственно, не реализована). Для реализации прозрачности нужно знать, что находится под гифом, а это, на мой взгляд, в общем случае задача нетривиальная. В качестве замены прозрачные области GIF'а заливаются предполагаемым цветом фона, на котором лежит картинка (по умолчанию действительно COLOR_3DFACE). Этот цвет можно изменить функцией CPictureEx::SetBkColor(COLORREF), о чем и написано, кстати, в сопроводительной статье.

Не могли бы Вы написать мне подробнее о доработке на e-mail : oleg_bykoff@rsdn.ru ? Если это действительно что-то стоящее, я с удовольствием внесу исправления и упомяну Ваше имя в сопроводительной статье и в комментариях класса.