E>Как только версия станет публичной, сигнатуры все равно будут добавлены антивирусами и появятся ложные срабатывания.
E>По началу, возможно, ложных срабатываний нет, но гарантий на будущее никаких.

Если ключ шифрования менять постоянно и антивирусы не будет успевать сигнатуры менять.

E>Для решения проблемы ложных детектов целесообразнее, все таки, использовать подпись цифровым сертификатом.

Уже есть — не помогло и переписка с ними тоже не помогла.