CD> Ну то есть, как оценивать взнос каждого в проект, чтобы потом не было претензий?

По-моему всё просто и описано в бухучёте. Нужно сделать компанию (виртуально, без регистрации в госорганах), вносить деньги в её уставной капитал, с этих денег выплачивать заработную плату. Тот кто работает много и его работа принимается — получит свои деньги обратно и реинвестирует, увеличив свою долю в компании.
Для того, чтобы один не захватил право оценки (сделав более 50% работы), оговорить, что блокирующий пакет, это скажем 25%+1 акция. Тогда по мере уменьшения доли у второго участника будет стимул восстанавливать паритет ударной работой.