1. Есть ли протектор на EXE файлах?
Я давно отказался от них, т.к. увеличилось число false positive.

2. Есть ли codesign на всех EXE продукта? Попробуйте подписать, может помочь со временем.

3. В продукте есть куча ресурсов, которые распаковываются при запуске и скидываются в temp папку, например DLL'ки. Но правда, есть нюанс, у меня все они зашифрованы типа ксором, может это помогает избежать сканирования.

Если все выше неактуально, то остается только посылать жалобы на false positive каждому разработчику антивируса.

У меня последние несколько лет сильно убавилось число false positive, после жалоб в предыдущие годы. может в white list внесли, не знаю.