По некоторым причинам хочу подержать деньги у регистратора. Т.е. не переводить на банк.
У регистратора такая опция включается просто.

Нормально ли это будет с точки зрения валютного контроля?

Выглядеть для ВК это будет так:
1. За Сентябрь 2015 — 0.
2. За Октябрь 2015 — N денег.

Соответственно за Сентябрь никаких бумаг нет. За Октябрь делаем акт на нужную сумму.

Не повлечет ли это штрафов за просрочку?