Цитата из rsdn.format / Specification:

Параграфы

Начало строки — начало параграфа. Перенос строки — конец параграфа.

One Two
Three

Выходной HTML

<p class='plain-text'>One Two</p>
<p class='plain-text'>Three</p>

Предлагаю изменить на:

Параграфом является любой текст, не входящий в другие блочные элементы.
Переносы строк внутри параграфа сохраняются (заменяются на <br/>).

Конец параграфа:
* пустая строка (или строка из пробелов)
* следующий блочный элемент
* конец документа

То есть из

This is a first paragraph,
on multiple lines.

This is a second paragraph
which has multiple lines too.

получаем

<p>This is a first paragraph,<br/>on multiple lines.</p>
<p><br/></p>
<p>This is a second paragraph,<br/>which has multiple lines too.</p>