Как известно Хранимые процедуры CLR еще в 2005 MS SQL.
Но о широком использовании не слышал.
Наприер в 1С
Тест Гилева показал, что файловая быстрее файловая база на интерпретаторе быстрее SQL.
Из-за сложности алгоритмов тяжело вытащить все данные одним запросом. Приходится гонять данные с сервера на клиента по нескольку раз. Отсюда и тормоза.
Но вот если обязанности сервера приложений возьмут на себя Хранимые процедуры CLR ситуация может резко измениться.
Но теперь и инстрeменты на сервере SQL должны быть аналогичные что на сервере приложений, а именно доступ через Linq