Если после открытия проекта а Nemerle VS Integration у вас отсутствуют автодополнение при вводе, синтаксис некорректно подсвечивается и не работают подсказки, то скорее всего дело в том, что у вас в настройках задана ассоциация для расширения "n". Чтобы все вышеперечисленное заработало нужно зайти в настройки VS (Tools\Options...), выбрать в дереве настроек ветку Text editor\File Extention, и удалить запись начинающуюся с "n".

Эту запись обычно делает установка упрощенной интеграции (она позволяет работать с Немерле в отсутствии полноценной интеграции). Будущие версии инсталлятора должны автоматически удалять эту настройку, но при сборке проекта из командной строки эта проблема может возникать и в будущем.