Z> Стандартная версия — четыре цыфры 0.0.0.0
Z> никак не согу найти как их грамотно использовать. Я так понимаю их не
Z> просто так придумали

Именно просто так. Как хочешь так и используй.
Некоторые вообще не используют: например "MyCoolProgramm 2000"

Z> Подскажите принципы обзывания версий программ
В делфи же, в окне настрйки проекта написанно: minor.magor.release.build
Что не понятно?