TW>Вы упрорно не понимаете, что не нужно перехватывать пароль

Перехватывать нужно не пароль, а владение DNS. Что делает let's encrypt — подтверждает, что вы в самом деле имеете доступ к DNS данного домена. Это их назначение и единственная функция. Если вы каким-то образом продолбали пароли вашего регистрара (или хостите ваш DNS непонятно где и непонятно как), ССЗБ.