Здравствуйте, TailWind, Вы писали:

TW>Заливать/скачивать файлы
TW>Как лучше / проще сделать?

Лучше — поднимать собственную сетку с VPN-доступом, тогда даже наличие нескольких изолированных территорий не вызывает проблем. Ну или SharePoint Online купить — тогда нормальная система раздачи прав будет (на основе доменных учёток и групповых политик).
Проще — какой-нибудь дропбокс, есть секурные варианты с доступом по паролю и автоудалением через N времени.