2) если лень переставлять: netstat -s что говорит?
сделай netstat -s трижды.
1 раз перед измерением.
2 раз после копирования эталонного файла с А на В.
3 раз после копирования эталонного файла с В на А.
проанализируй результаты.
3) "электроника наука о контактах".
для связи используется две "пары", четыре проводника. по одной "паре" идет передача в одну сторону, по второй в обратную. если одна из "пар" одного из кабелей повреждена, или плохо контачит, у одного из компьютеров будет плохая связь в одном из направлений.