Здесь: https://github.com/rsdn/nemerle/commit/3b6941c59b01da3f926330f61a562b0556cd2b0a

Из Variables.wxi удалена (в том числе) строка

<?elseif $(var.NVer) = "net-4.5.1" ?>

И чо? Версия-то всё ещё 4.5.1, а бедный WiX спотыкается и не собирает инсталлятор!