А почему ошибся:

IMediaSample::GetSize
The GetSize method retrieves the size of the buffer.

Syntax

long GetSize(void);

Return Value

Returns the size of the buffer, in bytes. The size does not include the prefix bytes, if any.

Брал буффер с этим size, записывал в файл и у меня пропадали последние 8 байтов.
Сделал size + 8 все OK.

GetActualDataLength() возвращает такой же size как и GetSize().