Мне необходимо построить приложение, в котором я могу брать на вход видео, добавлять к нему аннотации и картинки поверх и сохранять как новое видео.

Соответственно 2 основных задачи: вывод поверх видео текста и картинок, запекание нового видео.

С помощью чего такое делают сейчас с учетом того, что хочу использовать .NET и WinForms?

Итого, что нашел сам:
DirectShow уже outdated, т.к. например в последнем DX SDK нету даже примеров проигрывания видео, а старый СДК не встает на виндовс 7
AudioVideoPlayback, который по сути тот же DXShow не поддерживает вывода дополнительных элементов поверх (точнее в гугле пишут, что есть такой пример, но в старом СДК, которое не ставится — см.выше)
WPF

Т.е. реально выбор или использовать старый DirectShow, например с DirectShowLib.Net или писать все на WPF (хотя я хотел на WinForms).

Какие еще есть альтернативы и, возможно, ошибки в моих рассуждениях?
Заранее спасибо.

Я бы взял DirectShowLib. Хоть идеологи MS и назвали DirectShow устаревшей, более новые технологии до нее еще не доросли, а поддержка DirectShow системой никуда не денется. Использовать ее с DirectShowLib и WinForms легко и приятно (по сравнению с С++ — по моему опыту).