Честно говоря за всю свою практику работы не видел ничего лучше тетради формата A4 с клеточкой и гелевой ручки -- честное слово, рисовать диаграмы в розе, заставлял бы секретаршу (если бы была) -- проведите замеры времени если не верите, роза или (кто-то посоветова) visual mind проиграет, а для не опытного проиграет в разы -- к тому же стеснит вас в выражении и как следствие в адекватности восприятия ваших мыслей... Для публикации можно использовать сканер и прочие следствия из сканера (FineReader, например, отдать секретарше).
Для того чтобы понять сказанное, нужно отбросить всякие "модно", "начальство требует", "как в соседней фирме", "говорят помогает", "так все делают", и подобное.