Личная база знаний всё время меняется, в результате могут образоваться битые ссылки.
1. Меняются названия якорей атрибута id в html5.
2. Меняются названия страниц html5.
3. Меняются относительные пути к страницам html5.
4. Меняются ссылки к внешним ресурсам html5.
5. Меняются значения внутренних и внешних ресурсов.

Последний пункт относится к переосмыслению понятий, когда думаешь, что это одно понятие, а оказывается, что другое.

Причём понятие не обязательно полностью меняет смысл.
1. Оно может получить уточнение от общего к частному.
2. Или напротив нужно обобщить его от частного к общему.
3. Но, конечно, и не исключён вариант полной смысловой замены.

Речь о том, что даже не битая ссылка может.
1. Указывать на неверный ресурс.
2. Неправильно охватывать текст.
Так что никакое индексирование бы в итоге не помогло.

Я искал ручное решение без специальных программ и "нашёл".

Смысл в том, что ничего специально делать не нужно. Ссылка прверяется в момент нажатия на неё.

Казалось бы это не совсем правильно ведь очевидно, что разведётся куча неправильных или битых ссылок.

Да разведётся, но если на них не тыкать, то они и не мешают. А если тыкать, то сразу и узнаешь правильные они или нет.

Если бы использовался простой текст, то проблем бы не было по принципу нет ссылок, нет проблем. Но на мой взгляд ссылки нужны так как они явно указывают связи.