N>Когда-то давно пользовался MS Project. Его функционал полностью устраивает, думаю, что там даже больше необходимого. Но надо бесплатное и на Линуксе запускать. В процессе подумал, что было бы здорово иметь в нём интеграцию с Гитхабом или Битбакетом. Как-то совсем не в курсе современных тенденций.

Jira нормально работает как таск/багтрекер. А что тебе вообще надо от софта?