Есть ещё пару мыслей по поводу такой интеграции:
1. Понравилось, как на JetBrains Confluence используются ссылки на 1 issue: http://www.jetbrains.net/confluence/display/TW/Benares+EAP+%28build+5433%29+Release+Notes#BenaresEAP%28build5433%29ReleaseNotes-UIimprovements#BenaresEAP(build5433)ReleaseNotes-Otherissues,
похоже, что это user macro, но пока исходников не нашлось. Что-то похожее упоминалось на Wishlist for the next version.
2. При интеграции JIRA в страницу Confluence я обычно ещё добавляю RSS feed на комментарии, что есть удобно.