JP>Подскажите, с чего начать. Как ТЗ писать? Как грамотно перейти?
Ну вообще-то переход на Navision — это нетривиальный процесс и по деньгам стоит обычно не одну сотню тысяч. При этом внедряют его консалтинговые компании, которые с радостью помогут Вам и в написании ТЗ и в разработке требований...

Соответственно — я бы начал с поиска такой консалтинговой компании.