Здравствуйте, olegkr, Вы писали:

O>Здравствуйте, Carrier, Вы писали:

C>>Для такого случая
O>Это не один случай. Скорее рутина. Видимо придется писать что-то свое.

Тот же diff может сравнивать каталоги, так что вопрос сводится к небольшому скрипту.
Все, что он должен сделать — создать пару каталогов, в один отправить отсортированные файлы КОТОРЫЕ сравнивают, в другой — отсортированные файлы С КАКИМИ сравнивают, и вызвать на каталоги diff. Перебор файлов тоже делается средствами шелла через for. Плюс парсинг результатов. Но, собственно, на этом "свое" и закончится.