Здравствуйте, dimpon,

Проверил:

Session hs = ...
Connection con = hs.connection();
Statement st = con.createStatement();
st.executeUpdate("insert into tab(name) values ('ABCDEF')");
//st.close();

Statement sta = con.createStatement();
ResultSet rs = sta.executeQuery("select @@identity");

while (rs.next())
{
  System.out.println("identity= " + rs.getInt(1));
}

Выдаёт "identity= 1".

Никаких доп. функций в hibernate.cfg.xml не стоит, только самое основное.