Здравствуйте, Ran, Вы писали:
Ran>Как в tomcat можно настроить безопасность сервера на котором он расположен.
Ran>Чтобы web приложения не имели доступ ко всей системе
Вообще-то RTFM:
http://tomcat.apache.org/tomcat-4.1-doc/security-manager-howto.html