Здравствуйте, sl.ex, Вы писали:

SE>В FireFox аплет пересоздается, но, в отличии от IE, JavaScript работает нормально — вызываются функции нового аплета. Вполне возможно, что это IE баг, однако, не понятно почему JVM старается пересоздать аплет вместо того чтобы остановить его сначала (stop) а потом запустить (start).
SE>Постараюсь разузнать на форумах microsoft'а про IE.

Попробуйте вместо <applet> поэксперементировать с <object> и <embed>