Здравствуйте, dream_inspector, Вы писали:
_>Проблема не в trim или не trim, а в том что приходится отфильтровывать созданные самим парсером ноды с именами #text. что-то вроде if(node.getNodeName.equalsIgnorecase("#text")) continue; 
_>Хотя насчет jaxb заметано, буду смотреть 
http://java.sun.com/j2se/1.4.2/docs/api/org/w3c/dom/Node.html
Там вверху javadoc написанно что из ноды приходит
if(node.getNodeType()==Node.ELEMENT_NODE) {
.....
}
