Здравствуйте, Alexey Voytsehovich.
Вы писали:

AV> Синхронизация начата
AV> Получение оборваных тем: [3694430, 3695164, 3681114, 3694617, 3694744, 3667542, 3696493, 3688276, 3696841, 3692733, 3687788, 3695107, 3687107, 3685835, 3626219, 3685919, 3694129, 3695877, 3692384, 3677641, 3695934, 3695794, 3686340, 3695956, 3691298, 3591979, 3696813, 3696029, 3684808, 3694019, 3696003, 3685449, 3695989, 3683842, 3696408, 3696724, 3696388, 3696610]
AV> 1392 байт для записи
AV> 6386094 байт для чтения
AV>...
AV> Caused by: java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space

Да. Есть пока такая проблема при получении огромной пачки сообщений за раз. RSDN SOAP сервис не даёт возможности разбить загрузку дополнительных тем по порциям.
Пока, как вариант, можно попробовать увеличить максимальный размер для кучи, добавив в rojac.cmd дополнительные ключи:

javaw.exe -Xmx=256M -cp "%CLASSPATH%" org.xblackcat.rojac.RojacLauncher