Сабж.
Что-то я не могу найти достоверную информацию сам.
Иногда в спеках материнок попадаются указания, что pcie3 поддерживается (например, https://ru.msi.com/Motherboard/Z97-GAMING-3/Specification),
но в спеках соответствующего чипсета — только pcie2 (https://www.intel.com/content/www/us/en/products/sku/82012/intel-z97-chipset/specifications.html)