Надо посмотреть напряжение на 12В и 5В линиях питания, в идеале осциллографом, а если его нету, то хотябы мультиметром.
Еще может быть что хреновый контакт в разъеме, но если хдд дохли на разных разъемах питания, то это врядли. А разъемы точно были разные? Может они на одном проводе висят зашлейфованные?
С температурой внутри корпуса проблем кстати нету?